Quel est le problème ? Vous avez trouvé le nouvel emplacement, qu'est ce qui vous pose problème ?
Si on analyse le paquet .deb, il y a des scripts pré et post / installation et suppression. Sur des paquets plus anciens (2.4.2 pour Debian Buster), on peut voir que les scripts déplacent le fichier de conf d'un plus ancien dossier vers un nouveau (cas de mise à jour).
En fait, en principe, l'agent cherche le fichier de config dans ces 2 dossiers (au moins).
Il est probable que, sur une machine neuve, si vous installer l'agent sans le configurer et que vous installez le fichier de conf dans /etc/ocsinventory, l'agent trouve bien la config et l'exécute ...
(D'ailleurs, le dossier 'par défaut' de log a aussi changé de /var/log/ocsinventory-client à /var/log/ocsinventory-agent, mais je préconise que vous inscriviez la ligne 'logfile=....' avec le dossier de votre choix, dans le fichier de conf.)